Rumah Sakit Islam “SUNAN KUDUS” merupakan institusi pelayanan kesehatan milik Yayasan Islam Kudus (YAKIS). Yayasan ini didirikan pada tanggal 08 Juni 1985 M / 17 Ramadhan 1405 H dengan Akte Noratis No. 15 tanggal 08 Juni 1985 M Notaris Benyamin Kusuma, SH. Jl. Tanjung No. 03 A Kudus.
Tujuan utama didirikan Yayasan Islam Kudus (YAKIS) adalah penyelenggara usaha kesehatan masyarakat sebagai perwujudan amaliyah sesuai dengan ajaran Islam, turut membantu pemerintah dalam rangka menyediakan sarana dan prasarana kesehatan di Kudus. Tepat pada tanggal 01 Oktober 1990 M / 12 Rabi’ul Awal 1411 H Rumah Sakit Islam “SUNAN KUDUS” dioperasikan pertama kali yang peresmiannya dilakukan oleh Bapak H. Moh. Ismail Gubernur Kepala Daerah Tingkat I Jawa Tengah.
Status dari Rumah Sakit Islam “SUNAN KUDUS” adalah Rumah Sakit Umum swasta type Madya (type C) berdasarkan penetapan kelas oleh 45 Dirgen Yanmed Nomor: YM.00.02.3.4.312 tanggal 28 April 1999 M